《东北奇妙故事之摇篮曲》是一部融合了东北民俗文化与悬疑元素的短剧，剧情围绕一首神秘的摇篮曲展开，揭示了家族秘密与恩怨纠葛。故事发生在一个虚构的东北小镇，主角林晓（女性）是一名返乡的年轻音乐人，在整理外婆遗物时，发现了一首古老的摇篮曲乐谱。这首曲子看似温柔，却隐藏着令人不安的旋律。当她哼唱时，小镇开始发生离奇事件：邻居家的婴儿夜夜啼哭，老人回忆起多年前的未解之谜。林晓在调查中逐渐发现，摇篮曲与外婆的过去紧密相连，背后牵扯到一段被掩盖的家族悲剧。
人物关系错综复杂。主角林晓是核心人物，她外表坚强但内心敏感，对音乐有天赋，却因家庭阴影回避情感。她的外婆陈秀兰（已故）是摇篮曲的创作者，曾是一名民间歌手，因丈夫死于非命而郁郁寡欢，最终留下这首诡异的曲调。林晓的舅舅陈刚（40多岁）是小镇的警察，性格固执，掌握着家族秘密的关键线索；他表面冷漠，实则努力保护林晓免受真相伤害。反派角色是邻村的寡妇刘翠花（50多岁），她与陈秀兰曾是密友，但因嫉妒和误会潜伏多年，故意利用摇篮曲制造恐慌，试图掩盖自己当年参与的一场谋杀案。此外，还有林晓的青梅竹马张磊（30岁左右），一名热衷民俗的作家，为林晓提供调查支持，但他的动机也暗藏私心——他想将此事写成畅销小说。
剧情详解从林晓哼唱摇篮曲开始。最初，她只是为创作新歌寻找灵感，但随着事件升级，她发现外婆的遗言中提到：“摇篮曲不完整，最后一段被撕毁。”柳翠花暗中破坏，让林晓误以为曲子被诅咒。关键转折点出现在林晓找到外婆的日记，记载了1958年的一场火灾，火灾中死亡的人竟是刘翠花的丈夫，而真相是刘翠花因嫉妒故意纵火，想烧死陈秀兰，结果误杀了无辜。外婆从此心怀愧疚，用摇篮曲警示后人。结局中，林晓在舅舅协助下，通过音乐中隐藏的密码揭穿刘翠花，但选择不报警，而是让刘翠花在众人面前永远背负良心谴责。最终，林晓完成了完整的摇篮曲，用音乐治愈小镇的创伤，自己也释怀了家族阴影。