在《短剧系统逼我攻略，我却爱上善良的她》这部作品中，主角最后的感情归宿是选择与善良的女主角在一起。剧情发展围绕系统强制主角去攻略多个角色，但主角却因意外接触到女主角的纯真善良而产生了真挚的情感。最终，主角抵抗了系统的任务指令，勇敢地追随自己的内心，与女主角建立了牢固的感情联系。
故事的高潮部分，主角面临系统设定的巨大压力，系统不断尝试通过任务奖励或惩罚来胁迫主角完成攻略目标，但女主角的善良和无私逐渐打动了主角。女主角并非剧中设定的最优攻略对象，她的平凡与真诚反而凸显了主角对真实情感的渴望。主角在与系统的对抗中，选择牺牲可能的利益，守护与女主角的关系，这一决定成为剧情转折点。
结局时，主角成功摆脱系统的控制，系统因认识到人类情感的复杂性而调整规则，主角与女主角在平凡生活中找到了幸福。作品通过这一选择，探讨了爱情与系统逻辑的冲突，强调了自主选择与情感真实的重要性。主角的最终归宿并非预设的攻略目标，而是他内心真正认可的善良之人，这为观众呈现了一个关于爱与自由的温暖结局。